報 告 人：陳國波 副研究員
報告題目：大規模醫學遺傳數據分析與實踐
報告時間：2023年6月9日（周五）上午9：00
報告地點：靜遠樓1506
主辦單位：數學與統計學院、數學研究院、科學技術研究院
報告人簡介：
陳國波，2009年浙江大學數量遺傳學博士，2011~2015年澳大利亞昆士蘭大學大腦研究所博士后。2017年至今，浙江省人民醫院臨床醫學研究所副研究員。從事統計遺傳學研究，在Nature,Lancet,Am J Hum Genet,Hum Mol Genet,Bioinformatics,Mol Ecology等雜志發表論文40余篇，Google Scholar引用超3200次，H-index 19。
報告摘要：
醫學遺傳學數據逐漸涌現為數據挖掘與分析的重要場景，尤其DNA測序數據結合表型數據構成全基因組關聯分析（Genome-wide association studies，GWAS）的規范數據格式，直接可以作為各類醫學預測的數據源。但醫學數據和DNA數據受到隱私保護的各類限制，現實中很難直接使用或者交互，極大限制了數據體量的擴增。本研究采用隨機矩陣的計算框架，采用projection的方式，對基因型數據進行單向哈希加密，精準測算projection所需要的維度k與最終求解精度的量化關系，開發出適用于多方計算的encG-reg（encrypted genotype regression）。以兩份真實世界的UKBiobank的約50萬GWAS樣本以及中國本土6個基因組相關研究所的約6萬份GWAS樣本，展示了如何在多方計算下采用encG-reg完成醫學遺傳學數據的親屬鑒定，以及將要展開的進一步工作內容和數據分析層面的各類挑戰。